Ein Mann (Matt Damon) wird ohne Erinnerungsvermögen und mit schweren Schussverletzungen im Mittelmeer gefunden. Der Mann ohne Identität findet schließlich heraus, dass er Jason Bourne heißt und für die CIA gearbeitet hat. Diese hat jedoch Killer auf ihn gehetzt, was er sich nicht recht erklären

Die verwöhnte Abby (Britanny Murphy) begibt sich mit ihren Freund Ethan (Gabriel Mann) nach Toyko, doch er haut bald nach Osaka ab und kommt nicht mehr wieder. Alleine versucht sie sich durch Tokyo zu schlagen- mit schlechtem Japanisch und langweiligem Job bei einer Anwaltskanzlei. Eines Tages

Jason Bourne und seine Lebensgefährtin Marie leben zurückgezogen in Indien, doch der immer noch unter Amnesie leidende Jason wird jede Nacht von Alpträumen gequält. Als in Berlin zwei Agenten getötet werden, schiebt man ihm die Schuld in die Schuhe. Wieder setzt die CIA Agenten auf Bourne an und er